毛花獼猴桃雄株核心種質(zhì)構(gòu)建及遺傳多樣性分析

mihoutao 2021 年 4 月 9 日04:28:37評論705 views1閱讀模式

毛花獼猴桃雄株核心種質(zhì)構(gòu)建及遺傳多樣性分析
鄒梁峰
【摘要】:毛花獼猴桃(Actinidia eriantha)是獼猴桃屬(Actinidia Lindl.)的重要種類之一,是中國廣泛分布的特有的種質(zhì)資源。本研究以收集的207份毛花獼猴桃雄株為試驗材料,基于“表型性狀+SSR分子標(biāo)記”進(jìn)行核心種質(zhì)構(gòu)建并對其遺傳多樣性進(jìn)行研究,構(gòu)建了核心種質(zhì)的DNA指紋圖譜。主要研究結(jié)果如下:(1)在表型水平上構(gòu)建了毛花獼猴桃雄株初級核心種質(zhì)。從207份供試毛花獼猴桃雄株種質(zhì)中最終得到31份初級核心種質(zhì),取樣比例為14.95%。最佳取樣策略為:“歐氏距離+多次聚類優(yōu)先取樣法+類平均法+15%的取樣比例”,極差符合率(CR)、變異系數(shù)變化率(VR)、表型保留比例(RPR)和Shannon多樣性指數(shù)(H)分別為97.98%、130.54%、100.00%和1.78。對11個性狀遺傳多樣性指數(shù)進(jìn)行t檢驗,除了花粉活力存在顯著差異外,其他性狀均差異不顯著,主成分分析也發(fā)現(xiàn)初級核心種質(zhì)能很好的代表原始種質(zhì)?;谶z傳多樣性t檢驗中花粉活力存在顯著差異,于是對初級核心種質(zhì)進(jìn)行補(bǔ)充,使初始核心種質(zhì)變?yōu)?4份。(2)在分子水平上構(gòu)建了毛花獼猴桃雄株核心種質(zhì)。44份毛花獼猴桃雄株種質(zhì)基于稀有等位基因優(yōu)先取樣法達(dá)到26份核心種質(zhì),取樣比例為59.09%。44份初始核心種質(zhì)在23個SSR位點擴(kuò)增的等位基因數(shù)(n)、平均等位基因數(shù)(Na)、平均有效等位基因數(shù)(Ne)、平均Shannon多樣性指數(shù)(I)、平均期望雜合度(He)、平均Nei's遺傳多樣性指數(shù)(H)和平均多態(tài)信息含量(PIC)分別為:241、10.4348、5.7512、1.8647、0.7814、0.7716和0.778。26份核心種質(zhì)對應(yīng)的以上參數(shù)分別為234、10.087、6.104、1.916、0.810、0.792和0.796。核心種質(zhì)等位基因保留比例和表型保留比例為97.10%和97.92%,剔除了原始種質(zhì)中的遺傳冗余,使部分遺傳多樣性參數(shù)有所提高,構(gòu)建的核心種質(zhì)代表性較好。(3)利用SSR分子標(biāo)記對26份毛花獼猴桃雄株核心種質(zhì)進(jìn)行遺傳多樣性分析及聚類分析,并構(gòu)建其DNA指紋圖譜,以期為獼猴桃分子輔助育種奠定基礎(chǔ)。進(jìn)行毛花獼猴桃雄性資源核心種質(zhì)的遺傳多樣性分析及分子指紋圖譜的構(gòu)建。對23條引物的擴(kuò)增結(jié)果進(jìn)行多態(tài)性分析,結(jié)果表明26份核心種質(zhì)共擴(kuò)增出234條DNA條帶,其中多態(tài)性條帶為234條,多態(tài)性條帶比率100%。擴(kuò)增條帶數(shù)最多的引物是UDK99-143,達(dá)21條,擴(kuò)增條帶數(shù)最少的引物是22,僅6條。SSR引物多態(tài)信息含量PIC值為0.480-0.935,平均多態(tài)信息含量為0.796。從23條引物中最少需要2對多態(tài)性引物(UDK99-143和A055)可以完全區(qū)分供試種質(zhì),同時構(gòu)建了分子指紋圖譜,使每份種質(zhì)均得到唯一的DNA分子指紋。構(gòu)建的核心種質(zhì)樹狀圖可將核心種質(zhì)分為八大類。

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